STRUTS-13の対応でFormBeanであれば、必ずBeanValidatorFormにラップされるようになりました。

Strutsでは、POJO Formを受け取ったとき、BeanValidatorFormでラップして処理します。
<s2struts:init>タグの初期表示のときは、DtoそのままがRequestに設定されるので
<m:write id="hogeId" value="${fooDto.hoge}" />
のような処理が行えますが、
Actionを経由するとPOJO FormのfooDtoはBeanValidatorFormでラップされて
Requestに設定されるので
<m:write id="hogeId" value="${fooDto.instance.hoge}" />
のように処理しなければならなくなります。
＃strutsカスタムタグはこの違いを考慮しているので問題ありません。

S2Strutsで対応しようと思っておりますが、時間がかかりそうです。

暫定の回避案ですが、下のようにすると期待した動作をすると思います。
<m:if test="${fooDto.instance != null}">
<m:exec script="${ request.setAttribute('fooDto', fooDto.instance); }"/>
</m:if>
<m:write value="${fooDto.hoge}" />